Решением Учёного Совета Наркомздрава от 4 апреля 1920 года было утверждено открытие медицинского факультета при Смоленском университете. С этого момента и ведёт свою историю медицинский вуз Смоленска. В апреле 1930 года медицинский факультет был преобразован в Смоленский государственный медицинский институт. А в 1994 году стал академией.

За всю историю существования вуза из его стен было выпущено более 28 тысяч квалифицированных специалистов.